生物醫學暨工程學院於83年本校改制大學同時成立，學院所在的地點，是陽明大學創校以來的第二棟大樓。集合醫事技術學系（含醫事檢驗及放射技術二組）、物理治療學系、醫學工程研究所，以及醫學生物技術研究所共四學術單位，涵蓋五專業領域。
由孟粹珠教授代理首任院長；並於次年3月遴聘吳國海教授擔任本院首任院長；87年8月遴聘劉武哲教授為第二任院長；91年由王瑞瑤教授代理；92年8月遴聘邱爾德教授為第三任院長；98年8月張正教授遴選為第四任院長；104年8月遴選吳俊忠教授為第五任院長；110年8月遴選林峻立教授為第六任院長。
隨著醫學技術及工程領域日新月異之潮流趨勢，本院之成員系所亦幾經變革，由原先創院之四個單位陸續擴增至現有之四系一所，以及兩個學士學位學程之規模。
